O AEE – Atendimento Educacional Especializado é realizado na APAE de Palmeiras de Goiás pela Educadora Social Talitha Heloá Cândida dos Santos e pelo Educador Artesão Hélio Rodrigues da Silva. Os alunos fazem atividades pedagógicas diversificadas com o objetivo de trabalhar suas dificuldades apresentadas na rede de ensino regular. Além do momento da sala do AEE o educando recebe terapia na área da saúde com os profissionais da Fonoaudiologia, Fisioterapia, Psicologia, Neuropsicopedagogia, dentre outros. O AEE foi criado para atender o público-alvo do Ensino Regular no contra turno na APAE de Palmeiras de Goiás, são crianças com Deficiências Intelectual e Múltipla, transtorno do espectro autista. Ele é um serviço de apoio à sala de aula comum, para que se ofereça meios e modos que efetive o real aprendizado dos estudantes.